Depois do título da II Liga em 2023/2024, os açorianos protagonizaram um regresso fulgurante ao principal escalão do futebol nacional, ao terminarem em quinto lugar, com 17 vitórias, seis empates e 11 derrotas, superando a melhor classificação de sempre do clube I Liga, o sexto lugar de 2020/21.
Na derradeira jornada do campeonato, o Santa Clara venceu o Farense (2-1) e beneficiou da derrota do Vitória de Guimarães frente ao Sporting (2-0) para carimbar o regresso à Liga Conferência, após a estreia em 2021/22.
Os comandados de Vasco Matos bateram o recorde de pontos a quatro jornadas do fim e acabaram a competição com 57, mais 11 do que o anterior máximo, atingido em 2020/21.
O Santa Clara fez da solidez defensiva uma das suas principais 'armas', tendo sido a quinta defesa menos batida do campeonato com 32 golos sofridos (mais dois do que FC Porto e Sporting de Braga).
A equipa açoriana foi bastante regular ao longo do campeonato (nunca saiu dos sete primeiro lugares) e atingiu o melhor registo na reta final da prova, ao conseguir estar cinco jogos sem perder nas últimas jornadas (três vitórias e dois empates).
No sentido inverso, o pior registo aconteceu quando os 'encarnados' de Ponta Delgada estiveram quatro jogos sem vencer entre a 22.ª e a 25.ª jornadas (dois empates e duas derrotas).
Em destaque na época do Santa Clara estiveram Gabriel Batista, MT e Gabriel Silva (os três jogadores com mais minutos no campeonato) e o central Luís Rocha, além dos dois goleadores da equipa, Vinicius (oito golos) e Ricardinho (sete).
A trajetória do conjunto açoriano teve com um dos pontos altos a vitória no Estádio de Alvalade, frente ao Sporting, à 12.ª jornada (1-0), e o empate no estádio do Dragão, diante o FC Porto, à 19.ª jornada (1-1).
A temporada histórica do Santa Clara acaba, também, por ter como um dos principais rostos o do treinador Vasco Matos, que assumiu a liderança dos açorianos na segunda divisão e conseguiu, em duas épocas, qualificar a equipa para as competições europeias.
O Santa Clara foi uma das quatro equipas da I Liga que não mudou de treinador no decurso da época.
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